Το Εθνικό Αθλητικό Κέντρο αποτελεί Νομικό Πρόσωπο Δημοσίου Δικαίου και ιδρύθηκε το έτος 2000 δυνάμει του υπ` αριθμ. 54/2000 Προεδρικού Διατάγματος σύμφωνα με το οποίο παράλληλα καταργήθηκαν ως φορείς το Εθνικό Στάδιο Χανίων και το Εθνικό Ναυταθλητικό Κέντρο Χανίων. Εν συνεχεία δυνάμει του νόμου 4002/2011 καταργήθηκε ως φορέας του Εθνικό Σκοπευτήριο Χανίων και συγχωνεύτηκε με το Εθνικό Αθλητικό Κέντρο Χανίων (Ε.Α.Κ.).

Η λειτουργία του Ε.Α.Κ. Χανίων διέπεται από τις διατάξεις του Ν. 423/1976 “Περί Γυμναστηρίων και ρυθμίσεως θεμάτων αφορώντων τον εξωσχολικόν αθλητισμόν”, του Προεδρικού Διατάγματος 456/1988 “Οργάνωση και Λειτουργία Γυμναστηρίων”, της Υπουργικής Απόφασης 17112/2000 “Κανονισμός λειτουργίας των εθνικών και Δημοτικών Γυμναστηρίων της χώρας και του Νομοθετικού διατάγματος “Περί Λογιστικού των ΝΠΔΔ”, όπως αυτά έχουν τροποποιηθεί και ισχύουν.